Древняя ДНК выявила 12-тысячелетний случай редкого генетического расстройства

Исследователи из Венского университета и Университетского госпитального центра Льежа выявили генетические варианты, связанные с редким наследственным нарушением роста, у двух доисторических людей, живших более 12 000 лет назад. Используя анализ древней ДНК и современные методы клинической генетики, команда диагностировала это состояние у матери и дочери, похороненных вместе на юге Италии. Исследование, опубликованное в New England Journal of Medicine, демонстрирует, что палеогеномика может восстанавливать древнюю историю популяций и диагностировать редкие генетические заболевания у доисторических людей.

Открытие произошло в результате повторного анализа верхнепалеолитического захоронения, обнаруженного в 1963 году в пещере Гротта дель Ромито на юге Италии. В захоронении были два человека, похороненных вместе в объятиях: «Ромито 2», подросток с выраженным укорочением конечностей, ранее считавшийся мужчиной, и «Ромито 1», предположительно взрослая женщина. Рост Ромито 2 оценивался примерно в 110 см, что соответствует редкому скелетному нарушению роста, известному как акромезомелическая дисплазия, однако это нельзя было подтвердить только по костям. Ромито 1 также была ниже среднего роста для того периода — около 145 см. В течение десятилетий исследователи спорили о поле, родстве и возможности общей причины их низкого роста.

Команда проанализировала древнюю ДНК, извлечённую из каменистой части височной кости обоих индивидов — области, известной хорошим сохранением генетического материала. Генетический анализ подтвердил родство первой степени. Затем исследователи проверили гены, связанные с ростом скелета, и сравнили выявленные варианты с современными клиническими данными. Этот междисциплинарный подход, объединяющий палеогеномику, клиническую генетику и физическую антропологию, включал международную команду из Венского университета и сотрудников из Италии, Португалии и Бельгии.

Анализ показал, что оба индивида были женщинами и родственницами первой степени, скорее всего матерью и дочерью. У Ромито 2 был выявлен гомозиготный вариант в гене NPR2, который играет ключевую роль в росте костей. Это подтвердило диагноз акромезомелической дисплазии типа Марото — очень редкого наследственного заболевания, характеризующегося выраженным низким ростом и значительным укорочением конечностей. Генетические данные Ромито 1 указывают на то, что она несла одну изменённую копию того же гена, что связано с более мягкой формой низкого роста.

Рон Пинхаси из Венского университета, один из руководителей исследования, отметил, что благодаря анализу древней ДНК теперь можно выявлять конкретные мутации у доисторических людей, что помогает установить, насколько глубоко в прошлом существовали редкие генетические заболевания, а также потенциально обнаружить ранее неизвестные варианты. Даниэл Фернандес, первый автор исследования из Университета Коимбры, подчеркнул, что определение обоих индивидов как женщин и близких родственниц превращает это захоронение в семейный генетический случай, при этом более мягкий низкий рост старшей женщины, вероятно, отражает гетерозиготную мутацию, показывая, как один и тот же ген по-разному влиял на членов доисторической семьи. Адриан Дэйли из Университетского госпитального центра Льежа, также руководитель исследования, отметил, что редкие генетические заболевания не являются современным явлением, а присутствовали на протяжении всей истории человечества, и понимание их истории может помочь в распознавании таких состояний сегодня.

Несмотря на серьёзные физические ограничения, Ромито 2 выжила до подросткового или взрослого возраста, что свидетельствует о постоянной поддержке со стороны её сообщества. Альфредо Коппа из Университета Сапиенца в Риме, также руководивший исследованием, предположил, что её выживание требовало постоянной помощи со стороны группы, включая поддержку в питании и передвижении в сложных условиях.